Commission des impôts directs : sa compétence couvre les amortissements non comptabilisés

La commission des impôts directs peut examiner un désaccord sur la durée et le taux d’amortissement, même sans amortissement comptabilisé. Le Conseil d’État l’a jugé pour une SCI dont la plus-value de cession avait été recalculée après une vérification de comptabilité.

Luc Thilliez6 min de lecture

Façade d’un immeuble de bureaux aux fenêtres alignées, illustrant les amortissements soumis à la commission des impôts directs

L’essentiel

  • La commission des impôts directs connaît de toute question relative à l’application des règles d’amortissement à la situation du contribuable, y compris la durée et le taux.
  • Une cour commet une erreur de droit en écartant sa compétence au seul motif que la société n’a comptabilisé aucun amortissement.
  • Dans l’affaire jugée, l’administration avait réintégré au résultat 2016 d’une SCI les amortissements non pratiqués de 2009 à 2015 (art. 39 B du CGI), ce qui minorait le prix de revient de l’immeuble cédé.
  • La décision porte sur la procédure : elle ne tranche pas le bien-fondé du redressement.

La commission des impôts directs peut examiner un désaccord sur la durée et le taux d’amortissement, même si la société n’a comptabilisé aucun amortissement. Le Conseil d’État l’a jugé dans une affaire de plus-value immobilière 1.

Le juge de l’impôt précise ainsi le périmètre de la compétence de la commission départementale des impôts directs et des taxes sur le chiffre d’affaires en matière d’amortissements 1.

Un immeuble commercial acquis par crédit-bail

Le litige oppose l’administration fiscale à une société civile immobilière, la SCI K. La société a fait l’objet d’une vérification de comptabilité 1.

La SCI détenait un immeuble commercial acquis en 2008 par levée d’option de crédit-bail 1. Le crédit-bail permet d’utiliser un bien contre des loyers, avec la faculté de l’acheter en fin de contrat : c’est la levée d’option.

En levant l’option, la société est devenue propriétaire de l’immeuble. Le bien est alors entré dans son patrimoine pour un prix de revient, qui sert ensuite au calcul de la plus-value en cas de vente.

L’immeuble a été cédé. La plus-value de cession relevait du résultat de l’exercice 2016 de la société 1.

Amortissements non pratiqués : l’article 39 B du CGI

À l’issue de la vérification de comptabilité, l’administration a réintégré dans le résultat 2016 de la SCI K les amortissements non pratiqués entre 2009 et 2015 1. Elle l’a fait pour calculer la plus-value de cession de l’immeuble.

Elle s’est fondée sur l’article 39 B du Code général des impôts (CGI) 2. Ce texte impose à l’entreprise de pratiquer, à chaque exercice, un amortissement minimal. La fraction qu’elle a différée au-delà ne peut plus être déduite par la suite.

Pour le calcul de la plus-value, les amortissements non pratiqués sont donc pris en compte comme s’ils l’avaient été. Le prix de revient du bien a ainsi été minoré 1.

Un prix de revient plus faible augmente d’autant la plus-value imposable, donc le résultat de 2016.

Ce que contestait la SCI K

La société contestait le redressement sur plusieurs points 1 :

  • le principe même de la minoration du prix de revient ;
  • la durée d’amortissement retenue par l’administration ;
  • le taux d’amortissement appliqué.

Elle demandait aussi que le désaccord soit soumis à la commission départementale des impôts directs 1.

La cour administrative d’appel a écarté la compétence de la commission. Son seul motif : la société n’avait comptabilisé aucun amortissement 1.

Commission des impôts directs : son rôle dans le contrôle fiscal

La commission des impôts directs est un organisme consultatif. Elle réunit des représentants de l’administration et des contribuables, sous la présidence d’un magistrat administratif.

Le contribuable ou l’administration peut la saisir lorsqu’un désaccord persiste après une proposition de rectification. Son avis ne lie ni l’administration ni le juge.

Sa compétence porte en principe sur des questions de fait. Les questions de pur droit relèvent du juge de l’impôt.

La question posée au Conseil d’État était donc de savoir si un désaccord sur des amortissements jamais comptabilisés relevait encore de la commission.

La décision du Conseil d’État sur la compétence de la commission

Le Conseil d’État juge que la cour a commis une erreur de droit 1. Elle ne pouvait pas écarter la compétence de la commission au seul motif de l’absence de comptabilisation d’amortissements.

La commission connaît de toute question relative à l’application des règles d’amortissement à la situation du contribuable 1. Dans cette affaire, cela incluait la durée et le taux d’amortissement.

L’absence d’écriture comptable ne fait donc pas sortir le désaccord du champ de la commission. Ce qui compte est son objet : la façon dont les règles d’amortissement s’appliquent au bien de la société.

Commission des impôts directs et amortissements : le parcours du litige de la SCI K

Amortissements non pratiqués : du contrôle au Conseil d’État

Le litige de la SCI K, étape par étape

2008

Levée de l’option de crédit-bail : l’immeuble commercial entre dans le patrimoine de la SCI.

2009 à 2015

Aucun amortissement pratiqué sur l’immeuble.

2016

Plus-value de cession recalculée : prix de revient minoré des amortissements non pratiqués (art. 39 B du CGI).


La SCI conteste

Le principe de la minoration, la durée et le taux d’amortissement. Elle demande la saisine de la commission.

La cour refuse

Compétence de la commission écartée, au seul motif qu’aucun amortissement n’a été comptabilisé.

Conseil d’État

Erreur de droit de la cour

La commission connaît de toute question relative à l’application des règles d’amortissement à la situation du contribuable, durée et taux compris.

Chronologie de l’affaire : immeuble commercial acquis en 2008 par levée d’option de crédit-bail, amortissements non pratiqués de 2009 à 2015, plus-value du résultat 2016 recalculée sur le fondement de l’article 39 B du CGI, saisine de la commission refusée par la cour, puis erreur de droit relevée par le Conseil d’État.

Source : Conseil d’État, décision commentée le 20 juillet 2026 ; article 39 B du CGI

Une décision de procédure

La décision porte sur la compétence de la commission, c’est-à-dire sur la régularité de la procédure suivie 1. Les éléments rapportés ne disent pas si la durée et le taux retenus par l’administration étaient justifiés.

Le fond du redressement reste une autre question. La décision garantit seulement que la société pouvait faire examiner ce désaccord par la commission.

Un exemple pour fixer les idées

Prenons un exemple, purement illustratif. Une société acquiert un local commercial en levant l’option d’un crédit-bail, puis ne comptabilise aucun amortissement pendant plusieurs exercices.

Lors de la vente, l’administration recalcule la plus-value en tenant compte des amortissements non pratiqués. Elle retient une durée d’utilisation que la société juge trop courte.

Une durée plus courte se traduit par un taux d’amortissement plus élevé. Les amortissements pris en compte augmentent, le prix de revient baisse et la plus-value grossit.

Selon le raisonnement du Conseil d’État, ce désaccord sur la durée et le taux peut être soumis à la commission des impôts directs, même sans amortissement comptabilisé 1.

Contrôle fiscal : les points à vérifier dans votre société

Plusieurs précautions découlent de cette décision pour les sociétés qui détiennent des immeubles :

  • pratiquer et comptabiliser chaque exercice les amortissements des biens inscrits à l’actif ;
  • documenter la durée d’utilisation retenue pour chaque bien, qui commande le taux d’amortissement ;
  • vérifier le prix de revient d’un bien acquis par levée d’option de crédit-bail ;
  • en cas de désaccord sur la durée ou le taux, demander la saisine de la commission.

Le contrôle fiscal soulève d’autres questions d’accès au juge, comme le montre notre article sur le droit de communication fiscal et la QPC non transmise.

Pour un redressement que vous envisagez de contester, voyez aussi notre article sur les redressements de prélèvements sociaux d’une SASU à l’IR. La vente d’un immeuble par une société a enfin ses propres règles, comme pour le régime SIIC et la cession du dernier immeuble.

Faire le point sur vos amortissements

Chaque immeuble a son historique d’amortissement et ses règles propres. Les ingénieurs patrimoniaux PRIVEOS peuvent examiner avec vous la situation de vos sociétés immobilières. Prenez rendez-vous pour un premier échange.

Information à caractère général. Toute mise en œuvre nécessite une analyse personnalisée par un ingénieur patrimonial. Les éléments fiscaux mentionnés sont ceux en vigueur à la date de rédaction et susceptibles d’évolution. Article mis à jour le 20 juillet 2026.

Questions fréquentes

Qu’est-ce que la commission des impôts directs ?

C’est un organisme consultatif, la commission départementale des impôts directs et des taxes sur le chiffre d’affaires. Elle réunit des représentants de l’administration et des contribuables, sous la présidence d’un magistrat administratif. Saisie d’un désaccord qui persiste après une proposition de rectification, elle rend un avis qui ne lie ni l’administration ni le juge.

La commission des impôts directs est-elle compétente en matière d’amortissements ?

Oui. Selon le Conseil d’État, elle connaît de toute question relative à l’application des règles d’amortissement à la situation du contribuable, durée et taux compris. Une cour ne peut pas écarter sa compétence au seul motif que la société n’a comptabilisé aucun amortissement : c’est une erreur de droit.

Que risque une société qui ne pratique pas ses amortissements ?

L’article 39 B du CGI impose un amortissement minimal à chaque exercice ; la fraction différée au-delà ne peut plus être déduite. À la cession du bien, l’administration peut tenir compte des amortissements non pratiqués pour calculer la plus-value. Le prix de revient est alors minoré et la plus-value imposable augmente d’autant.

Sources

  1. 1.Conseil d’État, décision relative à la SCI K : compétence de la commission départementale des impôts directs et des taxes sur le chiffre d’affaires en matière d’amortissements, Conseil d’État, décision commentée le 20 juillet 2026
  2. 2.Code général des impôts, article 39 B (amortissements non pratiqués), Code général des impôts, version applicable aux exercices 2009 à 2016
Luc Thilliez

Rédigé par

Luc Thilliez

Ingénieur patrimonial, fondateur de PRIVEOS

Luc Thilliez accompagne chefs d’entreprise, cadres dirigeants et familles dans l’organisation de leur patrimoine : fiscalité, régimes matrimoniaux, transmission, patrimoine du dirigeant et situations internationales.

Fondateur de PRIVEOS, cabinet indépendant d’ingénierie patrimoniale rémunéré exclusivement par honoraires, il réunit plus de vingt ans d’expérience entre conseil patrimonial et développement d’entreprises.

Il est l’auteur de Tout savoir sur la SCI (Éditions Vuibert, 2026) et intervient dans les médias, du Figaro Immobilier aux podcasts Les Investisseurs 4.0 et Les Financiers.

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PRIVEOS est immatriculé à l’ORIAS sous le n° 23004036 et adhérent de l’ANACOFI sous le n° E0104466.

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