L’essentiel
- Un déficit reportable réputé entièrement imputé sur des exercices bénéficiaires prescrits ne peut plus être contrôlé ni rectifié par l’administration. Le Conseil d’État censure la théorie de la masse indistincte : le contrôle ne porte que sur le reliquat non imputé.
- L’imputation des déficits reportés est obligatoirement chronologique : l’entreprise impute d’abord le déficit le plus ancien (méthode FIFO).
- Dans l’affaire Faun Environnement, le reliquat à l’ouverture de 2013 était d’environ 1,4 M€, sur près de 5 millions d’euros de déficits accumulés depuis 2006.
- L’administration avait rectifié des charges de 2007 et 2008, exercices prescrits : la cour administrative d’appel de Paris a commis une erreur de droit en l’admettant.
Les déficits reportables déjà imputés sur des exercices prescrits échappent au contrôle de l’administration fiscale. Le Conseil d’État l’a jugé dans l’affaire Faun Environnement, en censurant la théorie de la « masse indistincte » 3.
La question se pose à toute société qui utilise un déficit ancien pour réduire un bénéfice récent : le fisc peut-il le remettre en cause ?
Déficits reportables : le mécanisme et ses limites
Le report en avant des déficits est codifié à l’article 209 du CGI 1. Une entreprise qui subit une perte la déduit de ses bénéfices futurs, ce qui lisse sa charge fiscale dans le temps.
Depuis septembre 2011, l’imputation annuelle est plafonnée. Elle est limitée à 1 M€, majoré de 50 % de la part du bénéfice qui dépasse ce million. Le déficit non imputé reste reportable sur les années suivantes.
Une imputation obligatoirement chronologique
L’imputation des déficits reportés sur un bénéfice suit un ordre imposé. L’entreprise applique la méthode FIFO : elle impute d’abord le déficit le plus ancien, puis les plus récents.
Le droit de reprise de l’administration
Le droit de reprise est encadré par l’article L. 169 du LPF 2. En matière d’impôt sur les sociétés, il limite l’action de l’administration à trois ans. Au-delà, les exercices sont prescrits.
La question est donc de savoir si l’administration peut remettre en cause un déficit très ancien, issu d’un exercice prescrit, au moment où l’entreprise l’utilise dans un exercice non prescrit.
Les faits de l’affaire Faun Environnement
La société Faun Environnement disposait à la clôture de l’exercice 2009 d’un stock de déficits reportables de près de 5 millions d’euros, accumulés depuis 2006.
En 2010, 2011 et 2012, elle a réalisé des bénéfices. Ces trois exercices étaient prescrits au moment du contrôle. Elle y a imputé une partie de ses déficits, conformément à la règle chronologique.
À l’ouverture de l’exercice 2013, premier exercice non prescrit, il restait un reliquat de déficit reportable d’environ 1,4 M€.
La rectification de l’administration
Lors d’une vérification de comptabilité portant sur 2013 et 2014, l’administration a remis en cause ce stock. Elle n’a pas contesté les déficits les plus récents. Elle a rectifié des charges afférentes aux exercices prescrits 2007 et 2008 : une provision et un mali de fusion.
Le stock de déficits utilisable en 2013 s’en trouvait réduit d’autant.
Ce qu’ont jugé le tribunal et la cour d’appel
La société soutenait que les déficits de 2007 et 2008, les plus anciens, avaient déjà été intégralement « consommés » par les bénéfices des exercices prescrits 2010 à 2012. Ils ne pouvaient donc plus faire l’objet d’un contrôle.
Le tribunal administratif de Montreuil, puis la cour administrative d’appel de Paris, ont rejeté cette analyse.
La cour a jugé que le reliquat disponible en 2013 résultait « indistinctement de l’ensemble des résultats déficitaires des exercices clos entre 2006 et 2009 ». L’administration pouvait donc rectifier n’importe quel déficit de cette masse.
Le Conseil d’État censure la masse indistincte
La société s’est pourvue en cassation. Elle soutient que les déficits de 2006, 2007 et 2008 ont nécessairement été imputés en priorité sur les bénéfices de 2010, 2011 et 2012, selon la règle chronologique.
Ces exercices bénéficiaires étaient eux-mêmes prescrits au moment du contrôle de 2013 et 2014. Les déficits intégralement consommés sur ces exercices devaient donc être définitivement intangibles et échapper au pouvoir de contrôle de l’administration.
Le Conseil d’État censure la théorie de la masse indistincte pour erreur de droit 3. Il rappelle d’abord la règle d’imputation : les déficits sont reportés par ordre chronologique, en commençant par le plus ancien, et s’imputent sur l’intégralité du bénéfice, sous réserve du plafonnement.
Il en tire ensuite cette conséquence :
[...] lorsqu’un déficit issu d’un exercice antérieur est, en application des règles énoncées au point 2, réputé avoir été entièrement imputé sur les résultats bénéficiaires d’exercices prescrits, l’administration fiscale n’est plus en droit d’exercer son pouvoir de contrôle et de rectification sur l’existence et le montant de ce déficit.
Deux sorts pour un même stock de déficits
Déficit imputé : intangible
Un déficit réputé entièrement imputé sur des exercices bénéficiaires prescrits ne peut plus être rectifié par l’administration.
Reliquat : contrôlable
Seule la fraction de déficit non imputée reste ouverte au contrôle et à la rectification.
L’affaire Faun Environnement en chiffres
| 2006 à 2009 | Stock de déficits reportables de près de 5 M€ à la clôture de 2009 |
| 2010 à 2012 | Bénéfices sur lesquels une partie des déficits est imputée, dans l’ordre chronologique (exercices prescrits) |
| Ouverture de 2013 | Reliquat d’environ 1,4 M€, premier exercice non prescrit |
| 2013 et 2014 | Vérification de comptabilité : l’administration rectifie des charges de 2007 et 2008 |
| Conseil d’État | Censure de la théorie de la masse indistincte pour erreur de droit |
Schéma de synthèse de l’affaire Faun Environnement : les déficits reportables imputés sur des exercices prescrits échappent au contrôle de l’administration, seul le reliquat reste contrôlable, avec les exercices et montants de l’affaire.
Source : Décision du Conseil d’État dans l’affaire Faun Environnement ; article 209 du CGI ; article L. 169 du LPF
Un effet de purge
L’imputation chronologique a un effet de purge. Les bénéfices réalisés durant un exercice, même prescrit, éteignent définitivement les déficits les plus anciens.
Une fois « consommés », ces déficits disparaissent. L’administration ne peut plus les remettre en cause lors d’un contrôle ultérieur.
Son droit de contrôle ne s’exerce donc que sur la fraction de déficit non imputée, c’est-à-dire le reliquat.
La cour administrative d’appel a commis une erreur en permettant de rectifier les déficits de 2007 et 2008. Elle aurait dû vérifier d’abord si les bénéfices de 2010 à 2012 ne les avaient pas déjà apurés.
Déficits reportables : ce qu’il faut retracer
Pour savoir quelle part d’un stock de déficits reste exposée à un contrôle, il faut reconstituer l’imputation année par année.
- L’exercice d’origine de chaque déficit.
- Les bénéfices sur lesquels il a été imputé, dans l’ordre chronologique.
- Le caractère prescrit ou non de ces exercices au moment du contrôle.
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Pour aller plus loin sur les déficits et la prescription
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Les textes sur Légifrance
Les textes cités figurent sur Légifrance : article 209 du CGI et article L. 169 du LPF.
Information à caractère général. Toute mise en œuvre nécessite une analyse personnalisée par un ingénieur patrimonial.
Les éléments fiscaux mentionnés sont ceux en vigueur à la date de rédaction et susceptibles d’évolution.
Article mis à jour le 17 novembre 2025.
Questions fréquentes
Qu’est-ce que l’imputation chronologique des déficits reportables ?
C’est la méthode FIFO imposée pour utiliser les déficits reportés. L’entreprise impute d’abord le déficit le plus ancien sur son bénéfice, puis les plus récents, dans la limite du plafonnement annuel de 1 M€, majoré de 50 % de la part du bénéfice qui dépasse ce million. Le déficit non imputé reste reportable.
L’administration peut-elle contrôler un déficit issu d’un exercice prescrit ?
Oui, tant que ce déficit n’est pas réputé imputé. Le Conseil d’État juge que l’administration n’a plus le droit de contrôler ni de rectifier un déficit réputé entièrement imputé sur des exercices bénéficiaires prescrits. Son contrôle ne s’exerce que sur la fraction non imputée, le reliquat.
Qu’est-ce que la théorie de la masse indistincte censurée par le Conseil d’État ?
La cour administrative d’appel de Paris jugeait que le reliquat disponible en 2013 résultait indistinctement de tous les déficits des exercices 2006 à 2009. L’administration pouvait donc en rectifier n’importe lequel. Le Conseil d’État censure cette analyse pour erreur de droit, car l’imputation chronologique éteint les déficits les plus anciens.
Quel est le délai de reprise de l’administration en matière d’impôt sur les sociétés ?
L’article L. 169 du LPF limite l’action de l’administration en matière d’IS à trois ans. Au-delà, les exercices sont prescrits. Un déficit issu d’un exercice prescrit reste toutefois contrôlable tant qu’il n’est pas réputé entièrement imputé sur des exercices bénéficiaires prescrits.
Sources
- 1.Code général des impôts, article 209 (report en avant des déficits), Légifrance, version citée par l’article du 17 novembre 2025
- 2.Livre des procédures fiscales, article L. 169 (droit de reprise), Légifrance, version citée par l’article du 17 novembre 2025
- 3.Décision du Conseil d’État, affaire Faun Environnement (date et numéro à confirmer), Conseil d’État, novembre 2025

Rédigé par
Luc Thilliez
Ingénieur patrimonial, fondateur de PRIVEOS
Luc Thilliez accompagne chefs d’entreprise, cadres dirigeants et familles dans l’organisation de leur patrimoine : fiscalité, régimes matrimoniaux, transmission, patrimoine du dirigeant et situations internationales.
Fondateur de PRIVEOS, cabinet indépendant d’ingénierie patrimoniale rémunéré exclusivement par honoraires, il réunit plus de vingt ans d’expérience entre conseil patrimonial et développement d’entreprises.
Il est l’auteur de Tout savoir sur la SCI (Éditions Vuibert, 2026) et intervient dans les médias, du Figaro Immobilier aux podcasts Les Investisseurs 4.0 et Les Financiers.
PRIVEOS est immatriculé à l’ORIAS sous le n° 23004036 et adhérent de l’ANACOFI sous le n° E0104466.
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